GPU-ускорението в AMBER 11 подобрява ефективността на учените, занимаващи се с био-технологии

GPU-ускорението в AMBER 11 подобрява ефективността на учените, занимаващи се с био-технологии

В раздел: Новини от на 3.05.2010, 2,412 показвания


Традиционно времето, което е необходимо за извършването на научни изследвания при разработката на лекарствени препарати е доста сериозно и са необходими големи изчислителни ресурси за извършването на предварителните симулации, преди да се премине към производството и клинични тестове. AMBER 11 е едно от приложенията, които позволяват по-ефективното извършване на симулации при разработката на лекарства и приложението вече разполага с възможност за ускорение с помощта на графичния процесор (GPU). Именно благодарение на графичното ускорение вече е възможно да се извършват сложните изчисления, за които е необходим сериозен суперкомпютър, с висока скорост дори на една система с размерите на стандартен настолен компютър. Софтуерът AMBER 11 може да се възползва от допълнителното ускорение при наличието на съвместим NVIDIA-базиран графичен процесор, постигайки дори до 100-кратно ускорение спрямо извършването на същите изчисления само с помощта на процесора.



Примерно сравнение за извършване на определен тип изчисление с помощта на AMBER 11, достигайки до 11 пъти по-висока производителност при използване на Tesla C2050 спрямо използването на система с два 4-ядрени Xeon процесора. AMBER 11 може да работи не само върху специализираните професионални изчислителни решения Tesla, Но също така и върху GeForce серията потребителски решения, разбира се с не толкова висока производителност, колкото при използване на Tesla, но все пак по-бързо отколкото при използването на процесори. Разбира се ускорението, постигано с помощта на графичния процесор варира в различните изчисления, но при всички положения се забелязва доста сериозно подобрение в производителността. А намаленото време за изчисления означава и по-бързо извършване на симулации и естествено възможност за по-бързото разработване на съответните лекарствени препарати.

За подробности относно проекта AMBER 11 и GPU ускорението
За подробности относно програмата на NVIDIA Tesla Bio Workbench






Етикети: , , , ,


Коментарите са забранени.